사스코로나바이러스(SARS-CoV)는 새로이 발생된 질병인 사스의 원인 바이러스이다.
SARS-CoV capsid 구성성분인 N 단백질은 안정하고 바이러스 단백질 중 가장 많이 생성되
기 때문에, 항체가 생성되기 이전인 바이러스감염 초기 단계에서 검출이 가능하다. 이 N
단백질을 검출할 수 있는 진단소재를 발굴하기 위하여 무작위적으로 나열된 40개의 핵산
pool로부터 SELEX 과정을 통해 N 단백질에 특이적으로 결합하는 RNA aptamer를 스크리닝
하였다. 총 12회에 걸쳐 수행된 SELEX과정을 통해 최종 선별된 aptamer들에 대한 염기서열
분석, RNA 2차 구조분석, 그리고 aptamer-N 단백질과의 결합력 분석으로 각각 3.3 nM과
0.8 nM의 높은 결합 상수를 가지고 있는 2종의 aptamer를 발굴하였다. EMSA 분석과 RNA
competition 분석을 통해 선별된 aptamer들은 매우 높은 결합력으로 N 단백질의
C-terminal 도메인에 특이적으로 결합함을 확인 할 수 있었다. 또한 선별된 aptamer를 N
단백질을 집적하는 소자로 사용한 aptamer-based chemiluminescence enzyme immunoassay 기법을
확립하여 N 단백질 항체를 인간 혈청 내에서 검출할 수 있었다. 본 과제에서 발굴한 N 단백
질 인식 aptamer와 이를 사용한 N 단백질 진단기법은 사스바이러스 진단에 활용될 수 있을
것으로 전망된다.