본 과제는 전사체 분석을 위해 기존의 전사체 조립 프로그램들을 이용하여 전사체 재
조립 과정을 수행하고 효율적인 전사체 분석 및 유사도 비교를 통해서 사용자 중심의 효율
적인 시각화 도구를 개발하는 것을 목표로 하고 있다. 이를 위하여 본 연구진은 다음의 기
능을 담당하는 도구를 개발하였다. 개발 결과물을 구체적으로 나열하면 다음과 같다.
1. 위치 정보를 가진 블록 간의 유사도를 비교하기 위한 방법론 제시
2. 제안한 유사도 비교 방법론을 이용한 위치 정보를 가진 전사체 모형 간의 유사도 비교 기능
3. 불리언 질의를 통한 다중 전사체 간의 효율적 비교 기능
4. 2개 이상의 다중 predicted transcript 파일 간의 병렬적 배열을 통한 시각화
5. 기존의 annotation 정보와 predicted transcript 파일 간의 일대일 시각화
6. 동일한 옵션을 사용하여 2개 이상의 도구를 통합 구동시킬 수 있는 기능
7. 다양한 도구의 결과를 비교, 병합함으로써 기존보다 향상된 결과를 추론
8. *.GTF, *.GFF, *.BED 포맷의 파일들을 통일된 하나의 *.GTF 포맷으로 변환시키는
convertor 개발
9. GTF 포맷의 annotation 파일을 유전자 별로 파싱하여 지정된 데이터베이스에 저장해 주
는 기능
10. 데이터베이스를 통해서 파싱된 annotation 데이터를 입력으로 받아 유전자 모델 및 결
과 파일로 나온 predicted transcript 파일을 YFile을 이용해 시각화 해주는 기능