혈장은 임상적으로 여러 가지 질환에 대한 바이오마커를 찾기 위한 주요 검체로서 뿐 만 아니라 오믹
스 관련 기초 연구의 주된 연구검체로 사용되는 중요한 인체자원이다. 하지만 냉동되어 보관되는 혈
장을 사용하기 위하여 필요한 전처리 과정에서 시료의 변질우려가 있으므로 시료의 안정성을 확인하
고 높은 품질의 검체자원을 유지하여 연구자들에게 분양하기위해서 적절한 정도관리 방법의 개발과
이에 따른 표준작업 수순서의 확보는 다량의 시료를 보관하고 있는 인체 자원은행에서는 필수적인 요
건이다. 따라서 본 연구에서는 혈장시료 전처리과정의 원심분리 전의 샘플 지연시간 및 온도, 냉해동
반복조건 등에 따른 시료의 안정성을 테스트하기위한 정도관리 연구를 단백체 연구방법과 통계분석법
을 이용하여 개발하였으며 이에 따른 표준 작업 수순서를 제시하였다. 정도관리 지표 후보 ZAG 단백
질은 재조합 단백질 및 내부표준 펩타이드을 이용하여 절대 정량하였으며 그 외 60개 단백질은
label-free MRM 방법으로 상대 정량하였다. 이러한 단백체 데이터들에 대하여 실제 전처리 조건별
특이지표의 발굴을 위하여 통계분석을 실시하였다. 이 단계에서는 통계분석 절차들(PLS regression,
Mixed model, Friedman test, FDR method, Bonferroni method)을 통합한 R-script를 개발, 제시함하
여 일관된 통계분석이 가능하게 하였다. 본 연구의 결과로서 ZAG 단백질은 샘플에 따라, normal 및
질환군에 따라 일관성을 보이지 못하므로 정도관리 조건에 유의한 바이오마커로서 제안하기에는 근거가 부
족하였다. 그러나 원심분리전 4°C & 25°C에서 2시간 이후부터 전체적으로 단백질의 양적인 변화
가 관찰되었으며, 이중 약 12여개의 정도관리 바이오마커 후보단백질을 확인하였다. 60개 단백
체 지표 후보물질 중 75% 이상의 단백체에서 냉해동 반복 횟수에 따라 유의하게 감소하는 경향성을
보였다. 이와 같은 본 연구의 결과로 단백체, 통계 분석에 대한 표준작업 수순서를 제시함으로써 오믹
스 방법을 이용하여 혈장 시료를 분석, 관리하는 정부 연구 및 사업에서 표준적 방법으로서 유용하게
활용될 것으로 예상되며 이들 연구 및 사업의 재현성 및 신뢰도를 높이는데 기여할 것으로 여겨진다.
그리고 개발된 R-script는 단백체 정량자료 외에도, 다중의 결과변수들을 포함한 다양한 기초, 응용생
물학 및 임상적 실험 자료들에 대한 특이 지표를 판별하는 분석에도 널리 이용될 수 있을 것으로 판
단된다.